La mise en œuvre de l’INDH, repose essentiellement sur la lutte contre la pauvreté, l’exclusion et la précarité, ce qui permet de placer ses actions au centre des priorités de la politique économique et sociale du Royaume. La territorialisation de l’INDH, découle d’une démarche déconcentrée basée sur le ciblage des zones géographiques les plus démunies ainsi que sur les principes de participation effective des populations bénéficiaires, de planification stratégique, et de partenariats avec les différents acteurs locaux, et ce, dans le but d’assurer une meilleure réussite des projets programmés et de garantir leur convergence avec les programmes sectoriels.

La mise en œuvre de l'INDH est déclinée suivant une plateforme préparée par le gouvernement, sur la base des Hautes Instructions Royales, selon cinq programmes :

• Lutte contre l'exclusion en milieu urbain
• Lutte contre la pauvreté en milieu rural
• Lutte contre la précarité
• Programme transversal
• programme de mise à niveau territoriale.